Potensi besar yang dapat digunakan untuk pembelajaran kimia terdapat dalam Jmol. Jmol dapat digunakan secara daring maupun luring.
Untuk Jmol luring pengguna perlu tahu beberapa perintah yang dapat digunakan dalam Jmol sebab tidak semua perintah tersedia dalam menu utama Jmol.
Perintah-perintah umumnya dapat dijalankan melalui Console. Semua perintah dapat dibaca di sini.
Contoh web aplikasi jmol yang diunggah ke blog ini dari web stolaf dot edu adalah seperti berikut: http://blogchem.com/urip/jmol/jsmol/simple2.htm