Day: July 8, 2020

Metode Huckel atau teori orbital molekul Huckel, yang diusulkan oleh Erich Huckel pada tahun 1930, adalah metode orbital molekul sangat sederhana kombinasi linear orbital atom dalam penentuan energi orbital molekul dari π-elektron di molekul π-terdelokalisasi, seperti ethylene, benzena, butadiena, dan piridin. Ini adalah dasar teoretis untuk aturan Huckel untuk aromatisitas {\ displaystyle 4n + 2} 4n + 2π-elektron siklik, sistem planar. Itu kemudian diperluas ke molekul terkonjugasi seperti piridin, pirol dan furan yang mengandung atom selain karbon, yang dikenal dalam … Continue reading “Metode Huckel dan Aplikasi HuLiS”

Pendekatan docking molekuler dapat digunakan untuk menyelidiki interaksi antara molekul kecil dan protein pada tingkat atom, yang memungkinkan kita untuk memahami perilaku molekul kecil di situs pengikatan protein target, dan mekanisme biokimiawi dalam protein dan ligan b’n molekul. Video ini akan memberikan Anda petunjuk langkah demi langkah lengkap tentang docking Protein-ligand menggunakan Autodock MGL Tools:http://mgltools.scripps.edu/downloads Autogrid4 dan Autdock4: http: //autodock.scripps.edu/downloads … Buka Babel GUI: https: //github.com/openbabel/openbabe … Literatur: https: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/arti …http: //autodock.scripps.edu/faqs-help …https: //www.sciencedirect.com/topics / … Post Views: 80

Download: Download AutoDock Vina Input files: vina_tutorial.zip (0.05MB) Tutorial as wmv: vina_tutorial.wmv (8.9MB) Fitur KetepatanAutoDock Vina secara signifikan meningkatkan akurasi rata-rata prediksi mode mengikat dibandingkan dengan AutoDock 4, dilihat dari pengujian kami pada set pelatihan yang digunakan dalam pengembangan AutoDock 4. [*]Selain itu dan secara independen, AutoDock Vina telah diuji terhadap patokan penapisan virtual yang disebut Direktori Umpan Berguna oleh kelompok Watowich , dan ditemukan “pesaing kuat terhadap program lain, dan menjadi yang teratas dalam banyak kasus” . Perlu dicatat bahwa keenam program docking lainnya, yang dibandingkan, didistribusikan secara komersial.Kompatibilitas Alat AutoDockUntuk input … Continue reading “Manual AutoDock Vina”